主线故事
主线关卡共三大系列、十三章（含作为教学章节的序幕「此即明日」）。
每章格言后为该章发生的历史时间点；若出现特殊时间点，则在历史时间点后括注。
1.0 生者与余众
序幕·此即明日
The Storm is coming.
历史时间点：1966
章节摘要：序章_越过暴雨
第一章·在我们的时代里
Leave the rest to me.
历史时间点：1929
章节摘要：第一章_应许之地
第二章·夜色温柔
Don't forget me.
历史时间点：1929
章节摘要：第二章_记得我
第三章·故事一无所有
Have a nice dream.
历史时间点：1913
章节摘要：第三章_雨与新世界
第四章·老虎的金黄
Happy birthday to you.
历史时间点：1913
章节摘要：第四章_暴雨改革
第五章·洞穴的囚徒
Who led us to the exile in this cave.
历史时间点：1913 ～ 1914（特殊时间点：2007）
章节摘要：第五章_阿派朗学派
配套活动：洞穴的囚徒（v1.4 活动）
注：现实时间线为1913年，回忆时间点2007年详见正文。
第六章·今夜星光灿烂
We still have a show to enjoy.
历史时间点：1913
章节摘要：第六章_维也纳序曲
配套活动：今夜星光灿烂（v1.7 活动）
第七章·孤独之歌
We are all lonely.
历史时间点：1914、1990
章节摘要：第七章_最初的圆
配套活动：孤独之歌（v1.9 活动·1.0终章）
注：7TH-01《对角线》～ 7TH-27《酒神颂》发生于1914年；7TH-28《数轴的两端》～ 7TH-30《谢幕词》发生于1990年。
2.0 旅行归来
第八章·忧郁的热带
The Die Is Cast.
历史时间点：1990
章节摘要：第八章_热带骤雨
配套活动：忧郁的热带（v2.2 活动）
第九章·疯癫与文明
Our Mind Is a Prison.
历史时间点：1991
章节摘要：第九章_巴比伦之骰
配套活动：疯癫与文明（v2.6 活动）
第十章·复乐园
历史时间点：1991
章节摘要：第十章_复乐园
配套活动：复乐园_活动
3.0 故事的根须
第十一章·行于漫漫长路上
历史时间点：1920
章节摘要：第十一章_硫磺火
配套活动：行于漫漫长路上（v3.0 活动）